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自制薄层色谱硅胶板，在保证色谱质量的前提下，如需对薄层板进行特别处理和化学改性，以适应供试品分离的要求时，也可用实验室自制的薄层板。最常用的固定相有硅胶G、硅胶GF254、硅胶H、硅胶HF254、微晶纤维素等，其颗粒大小，一般要求粒径为10～40μm，加水或用羧甲基纤维素钠水溶液（0.2％～0.5％）适量调成糊状，均匀涂布于玻板上。使用涂布器徐布应能使固定相在玻板上涂成一层符合厚度要求的均匀薄层。玻板应光滑、平整，洗净后不附水珠。
但少数品种有特殊的要求。
用0.4％氢氧化钠溶液制备的硅胶G薄层板上，（苦地丁）
用0.5％氢氧化钠溶液制备的硅胶G薄层板上，（山香圆叶、陈皮、青皮、桑寄生、黄蜀葵花、橘红）
用1％氢氧化钠溶液制备的硅胶G薄层板上（瓦松、甘草、延胡索、蔓荆子）
用2％氢氧化钠溶液制备的硅胶G薄层板上，（苦参、罂粟壳）；
以含0.5％氢氧化钠的羧甲基纤维素钠溶液制备的硅胶G薄层板上，广东紫珠
以含4％醋酸钠的羧甲基纤维素钠溶液为黏合剂制备的硅胶G薄层板上，（桃枝、白果、银杏叶）
同一硅胶G薄层板上[取硅胶G10g、枸橼酸-磷酸氢二钠缓冲液(pH7.0)10ml、维生素C 60mg、羧甲基纤维素钠溶液20ml，调匀，铺板，室温避光晾干，50℃活化2小时后备用]，（绵马贯众）
以羧甲基纤维素钠为黏合剂的硅胶H薄层板上（大黄）
点于同一硅胶G薄层板上，CMC-Na溶液的浓度0.3-0.7%比较合适，实际操作中0.4％～0.5％最为实用；用水板制备，制板、点样要求高，通常只在用硫酸等作显色烤板才用，或用低至0.1%制备。
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